Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc138Q0VF22 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc138Q0VF22 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms