Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAX3

Fads2p1, Fatty acid desaturase 2-like protein FADS2P1, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fads2p1Q0VAX3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fads2p1Q0VAX3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fads2p1Q0VAX3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms