Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MitfQ08874 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MitfQ08874 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MitfQ08874 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms