Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah2Q06986 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms