Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Htr1fQ02284 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr1fQ02284 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms