Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmklr1P97468 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms