Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1bP97358 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms