Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc4P54775 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc4P54775 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc4P54775 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms