Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CnbpP53996 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CnbpP53996 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms