Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa11P50709 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms