Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rab20P35295 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab20P35295 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab20P35295 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms