Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sftpa1P35242 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sftpa1P35242 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms