Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmi1P25916 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmi1P25916 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms