Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm3P21107 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3P21107 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms