Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lama1P19137 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lama1P19137 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lama1P19137 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lama1P19137 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lama1P19137 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lama1P19137 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lama1P19137 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lama1P19137 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lama1P19137 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lama1P19137 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.6 ms