Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhoP15409 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhoP15409 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhoP15409 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhoP15409 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhoP15409 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhoP15409 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhoP15409 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhoP15409 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhoP15409 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhoP15409 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhoP15409 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhoP15409 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhoP15409 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhoP15409 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhoP15409 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RhoP15409 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RhoP15409 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RhoP15409 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhoP15409 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhoP15409 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhoP15409 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhoP15409 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhoP15409 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhoP15409 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhoP15409 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhoP15409 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhoP15409 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhoP15409 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhoP15409 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhoP15409 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhoP15409 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhoP15409 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhoP15409 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhoP15409 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhoP15409 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhoP15409 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhoP15409 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhoP15409 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RhoP15409 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhoP15409 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RhoP15409 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RhoP15409 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RhoP15409 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhoP15409 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhoP15409 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhoP15409 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhoP15409 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhoP15409 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhoP15409 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhoP15409 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhoP15409 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhoP15409 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhoP15409 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhoP15409 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhoP15409 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhoP15409 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhoP15409 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhoP15409 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhoP15409 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RhoP15409 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RhoP15409 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhoP15409 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhoP15409 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhoP15409 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhoP15409 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms