Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms