Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8720K9J7F4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8720K9J7F4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8720K9J7F4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8720K9J7F4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8720K9J7F4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms