Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calhm3J3QMI4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calhm3J3QMI4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calhm3J3QMI4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calhm3J3QMI4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calhm3J3QMI4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms