Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5218F6YH22 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.2 ms