Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pm20d2A3KG59 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms