Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbm6S4R1W5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm6S4R1W5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms