Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms