Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms