Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclk1Q9JLM8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dclk1Q9JLM8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms