Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIY8

Cml3, Probable N-acetyltransferase CML3, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml3Q9JIY8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml3Q9JIY8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 584.3 ms