Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc12a4Q9JIS8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms