Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SgshQ9EQ08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms