Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms