Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alpk1Q9CXB8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alpk1Q9CXB8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms