Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smtnl1Q99LM3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms