Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nlgn1Q99K10 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nlgn1Q99K10 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms