Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha12Q91Y18 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms