Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2lQ8VCC6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2lQ8VCC6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms