Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk8Q8R3L8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms