Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf13Q8K2W6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms