Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrif1Q8CDD9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Lrif1Q8CDD9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrif1Q8CDD9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms