Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp1Q8BJQ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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