Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cand1Q6ZQ38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms