Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Ttbk1Q6PCN3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ttbk1Q6PCN3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms