Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhb9Q6PB60 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 304.5 ms