Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smchd1Q6P5D8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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