Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ggnbp1Q6K1E7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms