Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms