Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Thsd7aQ69ZU6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Thsd7aQ69ZU6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.5 ms