Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms