Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd180Q62192 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd180Q62192 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms