Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd1Q61345 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms