Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc1Q5NCF2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms