Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spire1Q52KF3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spire1Q52KF3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.9 ms